Fenofibrate chủ yếu được sử dụng cho tăng cholesterol máu nguyên phát hoặc rối loạn lipid máu hỗn hợp. Fenofibrate dường như làm giảm nguy cơ mắc bệnh tim mạch và có thể là bệnh võng mạc đái tháo đường ở những người bị đái tháo đường,[7][8] và trước tiên được chỉ định để giảm sự tiến triển của bệnh võng mạc tiểu đường ở bệnh nhân đái tháo đường loại 2 và bệnh võng mạc đái tháo đường hiện có ở bệnh nhân đái tháo đường.[9] Thuốc cũng có vẻ hữu ích trong việc giảm nguy cơ cắt cụt chân trong cùng nhóm người này.[10] Fenofibrate cũng được sử dụng ngoài nhãn hiệu như một liệu pháp bổ sung nồng độ axit uric trong máu cao ở những người bị bệnh gút.[11]

Thuốc này được sử dụng cùng với chế độ ăn kiêng để giảm cholesterol lipoprotein mật độ thấp (LDL), cholesterol toàn phần, triglyceride (TG) và apolipoprotein B (apo B), và để tăng cholesterol lipoprotein mật độ cao (HDL) ở người trưởng thành tăng cholesterol máu hoặc rối loạn lipid máu hỗn hợp.[12]